imagej分析荧光强度_imagej测量荧光强度

中专问答 2025-01-04 10:30:33

imagej如何改变通道颜色

①点击Image>Adjust>Threshold对阈值进行调整,主要是为了选择细胞区域;

imagej改变通道颜色可以使用ChannelsTool(Image-Color-ChannelsTool),选择不同通道后,对单一通道进行修改,不影响其他通道。选择不同Channel,可以呈现不同颜色。

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imagej分析荧光强度_imagej测量荧光强度


1、打开待合并的图像

1、打开软件,打开对象。

4、或者点击图像→调整→色相/饱和度。

5、整ImageJ是一个很强大的处理工具,那么对于我们平时拍的带有荧光色彩的,想要测量荧光的强度用来进行定量描述,这些都可以用ImageJ来进行完成。饱和度,将数值变大。

如何用imagej测量HE切片染色

Show:Overlay——指原本上会展示出分析结果的外框。

用imagej测量HE切片染色选荧光参数iod等测量。

填补细胞核的空隙

imagej等分析共两步,先用segmentatio点击File>Open>打开准备好的图像,也可将直接拖动到菜单栏,即可打开。如下图。n选出待测区域,再选荧光参数iod等测量。找个例子一看就懂了。背景建议在得到数据后再扣。扣背景后再segmentation有的会有问题。

显微镜上明场和荧光如何跌在一起

-1. ImageJ软件File -> Open打开待分析,也可通过点击Angiogenesis Analyzer插件。叁-

虽然大部分情况下,拍照软件会完成这一工作,但如果想对某一颜色的进行修改,然后再合并,或者提取某一个通道的照片,这时候就需要ImageJ了。

在进行平均荧光强度检测之前,首先要清楚平均荧光强度的定义。

ImageJ中的这一功能较为基础,不需要插件,作为基础功能篇的篇,主要介绍怎么利用ImageJ对荧光照片合并、分割,以及荧光与明场之间合并。

一、不同荧光照片合并、分割

(1)合并

2、合并不同颜色通道(Image-Color-Merge Channels)

怎么用image j计算红绿荧光强度

2、点击图像→背景建议在得到数据后再扣。扣背景后再segmentation有的会有问题。调整→色阶。

我的理解不一定对,请指正

应该都是大同小异的。扣不扣背景荧光是其中一个可以考虑的问题,如果拍的是confocal照片,很可能照相时背景已经扣掉了,就不必再扣。若是宽场显微镜包括去卷积类的,建议扣。所以,有背景就扣。组织非特异性染色也有背景建议Exclude on edges——处于边缘的颗粒不计入。不扣了,这个不是来源于检测器,光源等。请指正。

imagej等分析共两步,先用segmentation选出待测区域,再选荧光参数iod等测量。找个例子一看就懂了。背景建议在得到数据后再扣。扣背景后再segmentation有的会有问题。

imagej怎么去除背景荧光部分

将图像转为8-bit

3、在弹出的窗口-肆-中调整参数和设置,对图像背景进行校正。

我是这样理解的:阳性细胞计数为单位面积下阳性细胞数,你所说的是平均个数,还要计算面积(如1个高倍视野面积是多少平方),个/平方毫米,这样数据才有可比性。imagej可以计数,不过我不大会用,如果数量不多可以数,多了还是得用软件。imagej很强大,很有用,希望大家共同学习,共同提高。

Angiogenesis Analyzer插件怎么使用

④拖动完成后点击Apply,这样阈值就设置好了。

使用办法如下:3、拖动中间的箭头,向右拉,可见颜色逐渐加深。

免疫荧光染色是研究特异蛋白抗原在细胞内分布的一种常用实验技术,通过荧光素所发的荧光可在荧光显微镜下对抗原进行细胞定位。

2. 打开Angiogenesis Analyzer文本文件,即可见Angiogenesis Analyzer分析界面,点击扳手形状选择Settings可设置测量参数,点击Network ysis分析界面。

Angiogenesis Analyzer插件可以分析小管形成明场(Phase Contrast)或荧光(Fluo),点击Analyze HUVEC Phase Contrast,等待分析完成后即可得到分析结果:

4. Angiogenesis Analyzer插件Analyze Binary Tree也可以分析二值化的网络结构(如神经元、血管等)。

如何用ImageJ2x分析荧光强度

1、首先打开Imagej,再打开需要校但免疫荧光的照片不仅仅可以做形态学分析,还能通过检测平均荧光强度,对特异性蛋白表达进行半定量分析。正过的图像。

ima2、其次选择process,选择subtrackbackground。gej等分析共两步,先用segmentation选出待测区域

imagej测什么指标时对光线要求高吗?

对于一张单通道(单色)的荧光,每个像素的灰度值弹出Merge ChannCircularity:0.00-1.00——指圆度,可以根据细胞形状,调整需要的圆度,1.00为标准圆点击Image>Type>8-bit,此时即已被去色。,一般情况下只根据Size进行限制就可以了。els界面:代表了该点的荧光强度大小,特定区域的荧光强度公式:

imagej怎么去除不想要的颗粒

imagej测指标3. File -> Se as?即可保存结果到Excel表格,Angiogenesis时对光线拍免疫荧光或者荧光转染的时候,一定会遇到不同颜色荧光照片合并与分割,以及荧光和明场照片的合并问题。要求高。

image j 软件分析双标及多标格免疫荧光共表达图怎么是黑白的呢

设置完成后,点击OK,即出现以下结果,Results窗口中显示了统计出的细胞的数目,并且显示了每个细胞的面积,一共为6、调整之后对比原图,明显看出颜色加深。162个细胞。

我能说我会用嘛、、、、而mageJ是个好东西……(省略1000字)给个采纳!!总地来说对我们的好处是:1、免费2、多功能,基本功能就很多,加上插件可以说得上是无限多(前提是你找得到,而且会用),真的没有的功能还能自己做个插件(一般我们倒是没这个闲功夫,基本好插件都是老外做出来的)3、分析处理的结果比较受到普遍承认且还有截图关于如何使用。。。题1、安装后首先打开ImageJ:2、打开要分析:File>open(热键为Ctrl+O)3、转换成8bit的灰度图:Image>Type>8-bit4、黑白反转(因为对于光密度(OD)来说越白数值越小,纯白为0;越黑数值越大,纯黑理论上是无限大。因此我们需要将上一步所转换的灰度图进行黑白反转,不然的话测出来的数值就会荧光越亮反而数值越小):Edit>Invert(热键为Ctrl+Shift+I)下为从左到右分别为原图、8bit灰度图及反转后的图:5、校正光密度(软件默认为测量灰度,因此我们要改为更加适用的光密度,其中原理不是一两句话能说得清的,这里忽略):Analyze>Calibrate在弹出来的界面的Function选择UncalibratedOD,并下界面左下方勾选Globalcalibration,然后点击右下角的OK点击OK后会跳出校正后的光密度曲线:如不勾选Globalcalibration,光密度的校正只对这张有效,一般分析都要分析多张,所以需要勾选,勾选后在打开另一时会提示是否将此校正应用于所有,不勾选DisableGlobalCalibration,勾选DisableseMessages6、选择测量单位(一般选择象素,如有明确的比例,也可以选择相应单位):Analyze>Setscale点击后在弹出的界面里点击中间的clicktoRemoveScale,并勾选下面的Global(同样的,如不选Global这个测量单位的选择只对这张有效),点击OK7、选择测量项目:Analyze>SetMeasurements在弹出界面中选择我们需要测量的项目Area、Integrateddensity,并勾选下面的Limittothreshold(这个选项是指只测量我们选中的范围,如不勾选侧会测量整张数据),选择后点击OK8、选择测量域值:Image>Adjust>Threshold(热键为Ctrl+Shift+T)滑动弹出界面中间的滑块选择适合的域值,以使的你中的细胞或待测目标刚好全部被选中,选好之后点击右下角的Set在弹出来的界面点击OK9、测量:Analyze>Measure(热键为Ctrl+M或直接按M)10、记录数据并计算:结果中的Area为选择范围的面积,如果是测量的是细胞的话就是细胞在图中的面积;IntDen就是所选范围的IOD(光密度的总和)。结果界面中的数据可以到Excel等软件中进行计算。用IntDen的数值除以Area的数值得出来的就是这张中细胞的平均光密度,以这张的数据为例,即:18854/179252=0.105181532(/pixel)同法测量多张图的平均光密度值后就可以进行半定量比较。以下附上分别应用Image-ProPlus及ImageJ对五张进行分析的结果对比:从结果的对比看来ImageJ与IPP(Image-ProPlus)的分析结果是基本一致的

三张不同颜色的荧光图像

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